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四维杂交反应试剂使用说明

在将PCR试剂和样本核酸加入毛细管后,在盖子内表面,以均匀涂抹方式加入1-1.2uL(20x)四维杂交绿液(4DH-Green(540nm),管上有“4DHG”标记),用之前需涡旋混匀;然后重新盖上盖子,做65~75g离心力离心15秒;做完PCR扩增后,将毛细管倒置离心后静置5分钟,再正向离心15秒;按下列程序在LightCycler 仪器上做温度扫描获得特征熔点曲线: 95度6分;30度6分;95度0秒0.2度/秒,采集数据选“cont”;40度30秒

在其他实时荧光PCR系统,如eppendorf的realplex系统(塑料管) 同样可按比例加四维杂交反应试剂做相应分析。

结果分析:

(1) 选适当的“Cº to Average”值,将阳性质控品(或标准品)的特征熔点Tmp值(用“Manual Tm”手调)确定。

(2) 比较样品中是否含有与阳性质控品(或标准品)的特征熔点Tmp值相同的峰,如果只有一个峰值与阳性质控品的特征熔点Tmp值在±1.0ºC范围内(可以看成同一个峰),则说明PCR反应的特异性比较好,TaqMan探针模式定量的结果准确性很高;如果一个峰值与阳性质控品的特征熔点Tmp值相距大于2.0ºC,则说明是非特异假阳性信号峰值;如果有多个峰,则说明PCR反应的特异性不好,有非特异假阳性信号成份存在,TaqMan探针模式定量的结果准确性不可靠;如果一个峰值与阳性质控品的特征熔点Tmp值相距在1.0-2.0ºC间,说明特异性信号成份和非特异性信号成份同时并存,TaqMan探针模式定量的结果存在一定量的误差。

保存:

避光。长期保存在-20 度,有效期可达一年。反复冻融不超过8次。2~8度保存不超30天。

包装:

100次反应/管(120uL)。 运输条件:避光、室温(10天内)。

备注:

为了方便,可以采用将4DHG试剂预先冻干于盖子上的方法。当PCR扩增完后,进行适当方式离心,将4DHG与PCR扩增产物混匀之后,再进行四维杂交分析。SYBR Green I 模式和双杂交探针模式,最好也在扩增完后,加入四维杂交4DH液(不含Green 染料),温度扫描得到的特征熔点Tmp值更好,更稳定,单管测量过程可再三重复(反应管存放于避光—20度处,可在一年内再次重复测量)。四维杂交液不可直接用于PCR扩增反应!本试剂盒目前仅用于研究,不用于临床诊断。

另外,应用四维杂交液可通过测定引物和探针的特征熔点温度Tmp而迅速获得稳定最佳扩增条件,从而在极短时间内开发出全新PCR试剂盒。

背景知识:

由于量子力学方程无解析解,因此引物和探针的熔点温度是无法确定计算出的。现有的引物和探针设计程序,无论是用多么好的计算方法,无论是用多么快的计算机,也只能得出估算值。所以真实的熔点温度值(Tmp)只能用测量得到。

引物和探针的特征熔点温度Tmp测定

取引物人工合成的冻干粉,用PCR级水或4DHD(四维杂交稀释液)配成50uM浓度。与引物互补序列寡核酸单链也配成同样浓度溶液。取PCR级水14uL,加入1uL将要做PCR反应的缓冲液(20x)或4DHB(四维杂交缓冲液),加入1uL四维杂交4DHG液,加入引物溶液2uL并加入互补序列单链溶液2uL,最后总体积为20uL。用20uL玻璃毛细管,在LightCycler上做熔解曲线扫描:在95ºC保持6分钟;降至30ºC保持6分钟;95度0秒0.2度/秒,采集数据选“cont”;40度30秒。

测定一个引物的Tmp值后,再测另外一个反向引物的Tmp值。如果两个引物的Tmp值有较大差距,重新合成引物及互补序列单链,再重测Tmp值,直到满意为止。探针的Tmp值可以同样测量。

测定Tmp值后,可将PCR的退火(杂交)温度设为Tmp—20ºC,保留10秒;延伸温度设为Tmp—5ºC,保留时间按25碱基/秒速度,根据扩增链长度算出,可适当增加10~15秒。PCR过程完成后接着扫熔解曲线,观察分析熔解曲线,如有非特异信号峰存在,可适当提高退火温度+5ºC。即要保证无杂信号峰出现,又要有足够的产出率,直至最佳状态。

加TaqMan探针应当在用SYBR Green I荧光染料获得最佳稳定PCR扩增状态之后,将SYBR Green I荧光染料用TaqMan探针替换。

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